Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pramef12Q9D2F1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pramef12Q9D2F1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms