Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Chordc1Q9D1P4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Chordc1Q9D1P4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Chordc1Q9D1P4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms