Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tspan11Q9D1D1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tspan11Q9D1D1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tspan11Q9D1D1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms