Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZG9

Pdzd11, PDZ domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd11Q9CZG9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pdzd11Q9CZG9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pdzd11Q9CZG9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms