Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zcchc8Q9CYA6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zcchc8Q9CYA6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Zcchc8Q9CYA6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms