Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rhobtb3Q9CTN4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rhobtb3Q9CTN4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms