Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQC3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9CQC3 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQC3 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQC3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQC3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQC3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQC3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQC3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms