Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZQ2

SHCBP1L, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHCBP1LQ9BZQ2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SHCBP1LQ9BZQ2 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SHCBP1LQ9BZQ2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms