Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GSDMCQ9BYG8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GSDMCQ9BYG8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms