Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
BBS2Q9BXC9 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BBS2Q9BXC9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms