Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX79

STRA6, Stimulated by retinoic acid gene 6 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRA6Q9BX79 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRA6Q9BX79 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRA6Q9BX79 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
STRA6Q9BX79 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms