Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLF1Q9BQI6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLF1Q9BQI6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLF1Q9BQI6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms