Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Bhlhe41Q99PV5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bhlhe41Q99PV5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bhlhe41Q99PV5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms