Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Dhx30Q99PU8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Dhx30Q99PU8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx30Q99PU8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx30Q99PU8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx30Q99PU8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx30Q99PU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Dhx30Q99PU8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms