Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn6Q99PL6 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Ubxn6Q99PL6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms