Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Rrbp1Q99PL5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Rrbp1Q99PL5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Rrbp1Q99PL5 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Rrbp1Q99PL5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms