Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Smim3Q99PE5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Smim3Q99PE5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Smim3Q99PE5 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.5 ms