Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tpgs1Q99MS8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Tpgs1Q99MS8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tpgs1Q99MS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms