Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BrapQ99MP8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BrapQ99MP8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
BrapQ99MP8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.6 ms