Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tm2d1Q99MB3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tm2d1Q99MB3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms