Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smtnl1Q99LM3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Smtnl1Q99LM3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms