Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE3

Lysmd3, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd3Q99LE3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lysmd3Q99LE3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lysmd3Q99LE3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lysmd3Q99LE3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.4 ms