Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TriobpQ99KW3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TriobpQ99KW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TriobpQ99KW3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms