Protein–RNA interactions for Protein: Q99J31

Ophn1, Oligophrenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ophn1Q99J31 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ophn1Q99J31 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ophn1Q99J31 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ophn1Q99J31 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.3 ms