Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPEPQ99797 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPEPQ99797 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MIPEPQ99797 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MIPEPQ99797 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MIPEPQ99797 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms