Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NDNQ99608 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDNQ99608 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDNQ99608 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDNQ99608 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDNQ99608 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDNQ99608 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NDNQ99608 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNQ99608 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNQ99608 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNQ99608 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDNQ99608 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDNQ99608 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDNQ99608 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NDNQ99608 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDNQ99608 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.3 ms