Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RPRD1AQ96P16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RPRD1AQ96P16 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RPRD1AQ96P16 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms