Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
FGD4Q96M96 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FGD4Q96M96 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FGD4Q96M96 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms