Protein–RNA interactions for Protein: Q96LL4

C8orf48, Uncharacterized protein C8orf48, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf48Q96LL4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf48Q96LL4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C8orf48Q96LL4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
C8orf48Q96LL4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms