Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PGBD1Q96JS3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PGBD1Q96JS3 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PGBD1Q96JS3 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms