Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
NMD3Q96D46 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NMD3Q96D46 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms