Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PHKBQ93100 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
PHKBQ93100 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms