Protein–RNA interactions for Protein: Q920B9

Supt16h, FACT complex subunit SPT16, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt16hQ920B9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Supt16hQ920B9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Supt16hQ920B9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Supt16hQ920B9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms