Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y18

Pcdha12, Protocadherin alpha 12, mousemouse

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha12Q91Y18 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Pcdha12Q91Y18 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pcdha12Q91Y18 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdha12Q91Y18 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms