Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SRSF12Q8WXF0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SRSF12Q8WXF0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms