Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Mark1Q8VHJ5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Mark1Q8VHJ5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mark1Q8VHJ5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91 ms