Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Krt79Q8VED5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Krt79Q8VED5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt79Q8VED5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms