Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.8■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.79■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.77■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC44.76■■■■■ 4.76
RB1CC1Q8TDY2 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.75■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC44.74■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.74■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC44.73■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC44.72■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC44.7■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.75
RB1CC1Q8TDY2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.69■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.69■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC44.68■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC44.67■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC44.66■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC44.65■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
RB1CC1Q8TDY2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.61■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.61■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC44.6■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.59■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC44.58■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
RB1CC1Q8TDY2 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC44.57■■■■■ 4.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms