Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
MCOLN3Q8TDD5 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MCOLN3Q8TDD5 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MCOLN3Q8TDD5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms