Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cdc16Q8R349 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cdc16Q8R349 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cdc16Q8R349 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cdc16Q8R349 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms