Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Atg10Q8R1P4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg10Q8R1P4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg10Q8R1P4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms