Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ANKRD53Q8N9V6 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ANKRD53Q8N9V6 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms