Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MSL3Q8N5Y2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MSL3Q8N5Y2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSL3Q8N5Y2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MSL3Q8N5Y2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms