Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Polr1eQ8K202 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Polr1eQ8K202 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms