Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
1700001C19RikQ8K168 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
1700001C19RikQ8K168 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700001C19RikQ8K168 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms