Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYU2

HACE1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, humanhuman

Predictions only

Length 909 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACE1Q8IYU2 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HACE1Q8IYU2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HACE1Q8IYU2 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms