Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWL1

SFTPA2, Pulmonary surfactant-associated protein A2, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPA2Q8IWL1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SFTPA2Q8IWL1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFTPA2Q8IWL1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.1 ms