Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC83Q8IWF9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC83Q8IWF9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC83Q8IWF9 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms