Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV76

PASD1, Circadian clock protein PASD1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PASD1Q8IV76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PASD1Q8IV76 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PASD1Q8IV76 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PASD1Q8IV76 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms