Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Usp27Q8CEG8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Usp27Q8CEG8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp27Q8CEG8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp27Q8CEG8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp27Q8CEG8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Usp27Q8CEG8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp27Q8CEG8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp27Q8CEG8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp27Q8CEG8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp27Q8CEG8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp27Q8CEG8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp27Q8CEG8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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